Прекрасная библиотека Федоровского геологического музея собрана Е.С. Федоровым, его учениками Е.Д. Стратановичем и В.В. Никитиным. Библиотека содержит книги по общей геологии, минералогии, петрографии, палеонтологии, литературе, истории, политике, химии, физике и пр. В библиотеке хранится одно из первых изданий "Капитала" 1896 года выпуска, уникальная книга "Начальные основания естественной истории" 1791 года, напечатанная в императорской типографии Санкт-Петербурга, редактором которой был Василий Севергин. Сегодня
в библиотеке хранится около 400 томов специальной литературы на французском, немецком, итальянском языках.